Shahed University

Determination of conformational epitopes on human immunoglobulin light chain by immunoinformatic

Fatemeh Hajighasemi | Soheila Rohani | Fatemah Sefid

URL :   http://research.shahed.ac.ir/WSR/WebPages/Report/PaperView.aspx?PaperID=106437
Date :  2019/03/06
Publish in :     3rd National Conference of Biological Sciences

Link :  http://ncbs3.damghaniau.ac.ir:81/fa/
Keywords : اپي توپ فضايي ، ايمونوگلوبولين انسان، زنجيره سبک، ايمونوانفورماتيک

Abstract :
زمینه و هدف: ایمونوگلوبولینهاimmunoglobulins (Igs) گروهی از پروتئینهای سرم هستند که نقش مهمی در دفاع علیه میکروارگانیسمها بر عهده دارند. ایمونوگلوبولینها از زنجیره های سبک و سنگین تشکیل شده اند. زنجیره های سبک بر اساس تفاوت در انتهای کربوکسیلی ناحیه ثابت خود به دو ایزوتیپ کاپاκ )) و لامبدا( λ )تقسیم می شوند. تغییرات قابل توجهی در نسبت زنجیره های کاپا به لامبدا میتواند در گسترش منوکلونال لنفوسیتهای B در بدخیمی سلولهای B یا در عفونت با ویروس ایدز در دوران جنینی روی دهد. جهت سنجش دقیق یا هدف گیری اختصاصی زنجیره های سبک برای اهداف درمانی، ابزارهایی شناسایی اختصاصی دارای حساسیت و ویژگی بالا از جمله انتی بادیهای منوکلونال مورد نیاز هستند و بدین جهت تعیین دقیق اپی توپ های اختصاصی زنجیره های سبک حائز اهمیت خاصی است. ایمونوانفورماتیک شاخه ای از علم ایمونولوژی است که با به کارگیری اطلاعات زیستی موجود در کامپیوتر به تشخیص دقیق تر بیماریها کمک میکند. هدف مطالعه حاضر بررسی و تعیین اپی توپهای ناپیوسته زنجیره سبک ایمونوگلوبولین انسان توسط ایمونوانفورماتیک میباشد. روش بررسی: توالی اسیدهای امینه و ساختار سوم زنجیره سبک ایمونوگلوبولین مرجع انسان در پایگاه اطلاعاتی PDB (Protein Data Bank)، ساختار دوم زنجیره سبک ایمونوگلوبولین توسط نرم افزار Phyre2 (Protein Homology/analogy Recognition Engine V 2.0) و اپی توپهای ناپیوسته زنجیره سبک ایمونوگلوبولین مرجع انسان توسط نرم افزار CEP تعیین شدند. یافته ها: در این مطالعه 5 اپی توپ فضایی در دومین ثابت زنجیره سبک ایمونوگلوبولین انسان توسط نرم افزار CEP شناسایی شد . اپی توپهای فوق الذکر درناحیه قرارگیری اسیدهای امینه شماره 100 الی 214 واقع شده اند. نتیجه گیری: در این پژوهش تعدادی از اپی توپهای فضایی دومین ثابت زنجیره سبک ایمونوگلوبولین انسان شناسایی شدند. این اپی توپها ابزارهای بسیار ارزشمندی جهت تولید انتی بادیهای مونوکلونال شناسایی کننده اختصاصی زنجیره سبک ایمونوگلوبولین انسان بوده و میتوانند به طور بالقوه برای تولید کیتهای تشخیص اختصاصی زنجیره سبک ، درمان برخی از بدخیمی های لنفوسیت B، تعیین نقشه اپی توپهای زنجیره سبک ایمونوگلوبولین انسان و مطالعات تکاملی مفید باشند.


http://ncbs3.damghaniau.ac.ir:81/fa/

Files in this item :
Download Name : 106437_11825789322.pdf
Size : 174Kb
Format : PDF