زمینه و هدف: عفونت‌های ناشی از مایکوپلاسماهای تناسلی می‌تواند تاثیرات منفی بر سلامت تناسلی مردان داشته و به ناباروری منتهی گردد. هدف از این تحقیق، بررسی وجود مایکوپلاسما هومینیس و اوره‌اپلاسما اوره‌الیتیکوم در نمونه‌های مایع منی مردان نابارور مراجعه‌کننده به پژوهشکده رویان توسط دو روش کشت و PCR و مقایسه این دو روش با یکدیگر بود. روش کار: در این مطالعه توصیفی-تحلیلی مقطعی، نمونه‌های مایع منی از 220 مرد نابارور اخذ و به سه بخش تقسیم گردید: بخش اول جهت انجام تست اسپرموگرام استفاده شد، بخش دوم�به محیط کشتPPLO broth تلقیح و سریعاً از فیلترهای 45/0 میکرومتر((µm عبور و طبق دستورالعمل، در محیط‌های اختصاصی مایع و جامد PPLO کشت و در دمای C˚37 و در مجاورت CO2 نگهداری شد�و بخش سوم نمونه به منظور انجام PCR استفاده شد که برای شناسائی اوره‌اپلاسما اوره‌الییتکوم از پرایمرهای U4 و U5 به منظور تکثیر ژن Urease این باکتری و برای مایکوپلاسما هومینیس از پرایمرهای RNAH1 و RNAH2 برای تکثیر ژن 16S rRNAاستفاده گردید؛ سپس یافته‌ها توسط نرم‌افزار SPSS V.16 تحلیل شد.�از ازمون‌های اماری ANOVA، Post Hoc، Crosstab، Chi Square و Mc Nemar استفاده شد. یافته‌ها: از مجموع 220 نمونه مایع منی بررسی شده با استفاده از روش کشت، 2/3 و با روش PCR 1/4 از نمونه‌ها فقط از نظر مایکوپلاسما هومینیس مثبت بود. با روش کشت، 7/27 و با PCR 1/29 فقط از نظر اوره‌اپلاسما اوره‌الیتیکوم مثبت بود؛ با روش کشت، 5 نمونه‌ها و با PCR، 4/11 از نظر هر دو باکتری مثبت بودند. در بررسی متغیرها در دو روش کشت و PCR، در دو گروه فقط اوره‌اپلاسما اوره‌الیتیکوم مثبت و هر دو باکتری مثبت، میانگین pH نسبت به گروه هردو باکتری منفی، پایین‌تر و اسیدی‌تر بود)(Culture)006/0(p= و)(PCR)000/0(p= و نیز قدرت تحرک اسپرم‌ها در گروه هردو باکتری مثبت نسبت به گروه فقط اوره‌اپلاسما اوره‌الیتیکوم مثبت، پایین‌تر بود)(Culture)032/0(p= و)(PCR)009/0(p=. نتیجه‌گیری: با توجه به یافته‌های این تحقیق، درصد نسبتاً بالایی از مردان نابارور به این باکتری‌ها الوده بوده‌اند و با توجه به عواقب خطرناک این عفونت‌ها، تشخیص به موقع این باکتری‌ها در مردان نابارور فاقد علائم بالینی، ضروری به نظر می‌رسد. PCR در مقایسه با کشت یک روش حساس‌تر، سریع‌تر و دارای ویژگی بالاتری می‌باشد.