زمینه و هدف: ایمونوگلوبولینها immunoglobulins (Igs) گلیکوپروتئینهای دفاعی بدن هستند که میکروبها را به صورت اختصاصی شناسایی و تخریب می کنند. ناحیه ای از انتی بادی که به انتی ژن متصل میشود، fragment of antigen binding (Fab) نامیده میشود که حاوی دومینهای متغیر و یک دومین ثابت از زنجیرههای ســبک و ســنگین میباشد. ایدیوتیپها که اپیتوپهای واقع بر ناحیه متغیر ایمونوگلوبولینها هستند، برای ردیابی و هدفگیری سلولهای B سرطانی بکار میروند و معمولا نزدیک شکاف های سطحی Igها واقع شده اند. هدف این پژوهش بــه کارگیری ایمونولــوژی محاسبه ای بـرای تعیـین شکاف های سطحی ناحیه Fab میباشد. مواد و روشها: توالی و ساختار سوم مولکول ایمونوگلوبولینG (IgG) مرجع انسان در پایگاه داده PDB (Protein Data Bank) بدست امدند. شکاف های سطحی ناحیه Fab-IgG توسط نرم افزارهای Profunc در پایگاه اینترنتی http://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/profunc و Isocleft finder تعیین گردیدند. یافته ها: ده شکاف در سطح مولکول IgG توسط نرم افزار Cleft Analysis شناسایی شدند. دو تا از بزرگترین این شکافها در ناحیه متغیر و سومین شکاف در ناحیه ثابت Fab واقع شده اند. همچنین سه شکاف توسط نرم افزار Isocleft finder شناسایی شدند که دو تا از انها از اشتراک دومینهای متغیر و ثابت و سومی از دومینهای ثابت ناحیه Fab تشکیل شده اند. نتیجه گیری: شکاف های سطحی IgG شناسایی شده در این مطالعه میتوانند در تعیین اپیتوپهای مولکول IgG، ایدیوتیپهای اختصاصی و تولید انتی بادیهای منوکلونـال اختصاصی ضد ایدیوتیپ جهت رد یابی و هدف گیری سلولهای B بدخیم، طراحی و تولید پروتئینهای مشابه برای اهداف تشخیصی و درمانی مورد استفاده قرار گیرند.