Shahed University

Importance of anamorphic characters in the genus Xylaria

S. Abdollah Hashemi | Rasool Zare | S. Akbar Khodaparast | S. Ali Elahinia

URL :   http://research.shahed.ac.ir/WSR/WebPages/Report/PaperView.aspx?PaperID=42351
Date :  2016/08/27
Publish in :    بيست و دومين کنگره گياهپزشکي ايران

Link :  https://ippc22.ut.ac.ir/
Keywords :genus, Xylaria

Abstract :
جنس Xylaria Hill ex Schrank ارایه تیپ تیره Xylariaceae است که بیش از 600 گونه را در بر می¬گیرد. مطالعات صورت گرفته توسط محققین مختلف در سالهای اخیر نشان داده است که این جنس تک¬نیایی نیست و گونه های کنونی ان به بیش از یک جنس تعلق دارند. با وجود این، تاکنون ویژگی ریخت شناسی جامعی که با گروه¬بندی تمام گونه¬های این جنس بر اساس مطالعات تبارشناسی مطابقت داشته باشد معرفی نشده است. از انجاییکه در سالهای اخیر چندین گونه این جنس از ایران گزارش شده است، به منظور تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی گونه های جنس Xylaria شناسایی¬شده در ایران، توالی¬های ناحیه rDNA ITS (شامل ژن 5.8S) گونه¬های شناسایی¬شده به همراه توالی¬های معتبر گرفته شده از بانک ژن مورد بررسی قرار گرفتند. DNA کل جدایه¬ها با استفاده از Chelex 5 استخراج و با یکی از جفت اغازگر¬های ITS1/ITS5/ITS1F و ITS4 تکثیر و توالی¬یابی شد. تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی با استفاده از نرم افزار MEGA 5.0 انجام شد. تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی گونه های جنس Xylaria شناسایی¬شده در ایران بر اساس توالی ناحیه rDNA ITS (شامل 5.8S) به همراه توالی¬های معتبر گرفته شده از بانک ژن نشان داد که گونه¬های این جنس حداقل در چهار گروه قابل دسته¬بندی هستند. گروه اول اغلب گونه¬های چوبزی دارای انامورف Geniculosporium-like سفید رنگ، گروه دوم گونه¬هایی که استرومای خود را روی برگ یا میوه تشکیل می¬دهند و انامورف انها مانند گروه قبلی است، گروه سوم گونه¬های چوبزی دارای انامورف Geniculosporium-like قهوه¬ای متمایل به سبز زیتونی و گروه چهارم اغلب گونه¬های چوبزی دارای انامورف Xylocoremium صورتی رنگ را در بر می گیرند. این گروه¬بندی (علیرغم وجود استثناهایی) با گروه¬بندی گونه¬ها بر اساس رنگ انامورف و محل تشکیل استروما همخوانی دارد. گروه دوم گونه تیپ جنس Kretzschmaria (K. clavus EF026126) را نیز در بر می گیرد که نشان دهنده پارافیلتیک بودن جنس Xylaria است. هرچند جنس¬های Geniculosporium-like، Xylocoremium و Moelleroclavus به عنوان انامورف¬های گونه های جنس Xylaria معرفی شده اند اما متاسفانه تاکنون مطالعات بسیار اندکی در خصوص ارتباط تلیومورف-انامورف گونه¬های این جنس انجام شده است و توالی ناحیه ITS اغلب گونه های ان در بانک ژن وجود ندارد که ممکن است فراهم کردن و استفاده از انها در تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی، گروه¬بندی ذکر شده را تغییر دهد. با وجود این به نظر می¬رسد در نظر گرفتن ویژگی های انامورف در جنس Xylaria (همانند برخی دیگر از جنس¬های تیره Xylariaceae) ممکن است به روشن شدن وضعیت این جنس کمک کند. مطالعه بیشتر در این خصوص در دست انجام است.


https://ippc22.ut.ac.ir/

Files in this item :
Download Name : 42351_4705450206.pdf
Size : 606Kb
Format : PDF