با توجه به بیماریزایی سودوموناس ایروجینوزا در ایجاد عفونتهای فرصت طلب و مقاومت بالای ان، طراحی واکسن های موثر ضروری به نظر می‌رسد. به نظر می¬رسد که پروتیین های OprF , OprI و PcrV به عنوان بهترین گزینهها جهت طراحی یک واکسن نوترکیب مناسب با استانداردهای لازم ‌باشند. در این مطالعه در ابتدا منابع اطلاعاتی مختلف جهت استخراج اطلاعات در مورد سه پروتیین OprF , OprI و PcrV مورد مطالعه قرار گرفت. سپس توالی¬ها از بانک¬های اطلاعاتی در دسترس مانند NCBI به دست امد و نواحی حفاظت شده در توالی¬ها تعیین شد. جهت مطالعه¬ی بیوانفورماتیکی بر روی توالی¬های انتخاب شده از ابزارهای مختلف و معتبر بیوانفورماتیکی استفاده شد، سازه مورد نظر طراحی شد و در نهایت درباره ویژگی¬های فیزیکوشیمیایی و ایمونولوژیکی سازه¬ی طراحی شده تحقیق شد. در این مطالعه پس از بررسی¬های متعدد نواحی مطلوب از پروتیین¬های ذکر شده توسط لینکر مناسب به هم متصل گردیدند و در نتیجه سازه¬ای به طول 362 اسید امینه بدست امد. پس از طراحی نهایی، توالی کانستراکت با نرم¬افزارهای بیوانفورماتیکی مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت و نشان داده شد که نواحی ایمونوژنیک در این سازه با نواحی ایمونوژنیک در پروتیین¬های مرجع همپوشانی (شباهت) بالایی داشتند، که همین امر موفقیت اولیه در انتخاب نواحی حفاظت شده را تایید می¬کند. مقایسه اپی¬توپ¬های ساختاری در سه پروتیین مرجع و سازه¬ی نهایی نشان داد که تقریبا تمامی اپی¬توپ¬های موجود در پروتیین¬های طبیعی، در سازه¬های نهایی نیز وجود داشتند.