بررسی تنوع ژنتیکی بهترین راه برای استفاده از ظرفیت ژنتیکی موجود در گیاه جو جهت برنامههای بهنژادی میباشد. در این بررسی تنوع ژنتیکی 63 ژنوتیپ ایرانی و غیر ایرانی جو تشریح شده است. از 30 جفت نشانگر ریزماهواره استفاده شده، 29 جفت چندشکلی مشاهده 7/ شد. در مجموع 225 الل برای مکانهای ژنی مختلف با میانگین 2 برای هر اغازگر شناسایی گردید. بیشترین تعداد الل برای جایگاههای با 13 الل) و کمترین ) EBmac و 679 Hvm54 ،Bmag0323 0/ از 89 PIC با 2 الل) بود. میزان ) HVM تعداد برای جایگاه 0003 و (GBM 0 (برای جایگاه 1176 / تا 21 (EBmac (برای جایگاه 679 تا (Bmag برای جایگاه 0323 ) I=2/ مقدار شاخص شانون از 46 متغیر بود. گروهبندی ژنوتیپها با (GBM برای جایگاه 1176 ) I=0/48 و تجزیه خوشهای با استفاده از روش ،Neighbor-net روش انجام گردید. در این روش بهترین تعداد زیر جمعیت 4 Bayesian عدد شناسایی شد که در اکثر زیرجمعیتها ژنوتیپهای با منشا ایران با Neighbor-net دیده شدند. نتایج گروهبندی حاصل از روش روش مبتنی بر مدل مطابقت زیادی نشان داد. نتایج این تحقیق نشان داد که نشانگرهای ریزماهواره تنوع ژنوتیپهای مختلف جو را بهخوبی نمایش میدهند. همچنین با توجه به نتایج به دست امده، ژنوتیپهای بومی ایران نیز تنوع بالایی را از خود نشان دادند.